GeoSPM
Phobi (PHOqueBactériesvIrus)
Evaluer les interactions entre les phoques et les activités humaines à Saint-Pierre et Miquelon est un sujet important, car peu de données sont disponibles. L’analyse de la communauté microbiologique des fèces sera réalisée par des approches de métabarcoding et métagénomique. Les résultats permettront de développer un marqueur spécifique pour ces mammifères et de caractériser la diversité virale.
Simple
- Date (Creation)
- 2021-01-11
- Date (Publication)
- 2021-07-07
- Citation identifier
- FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_PHOBI_PHO_BACT_VIR
- Citation identifier
- DOI:10.12770/76beca06-ac02-49ce-810e-94f9c121e868
- Credit
-
Ifremer - Laboratoire Sante Environnement Microbiologie (LSEM)
- Point of contact
-
Organisation name Individual name Electronic mail address Role IFREMER
sismer@ifremer
Publisher IFREMER
Schaeffer Julien
Author
-
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
-
-
Habitats et biotopes
-
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Thèmes Sextant
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-
/Milieu biologique/Bio-Informatique
-
-
ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names
-
-
Bioinformatique
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- Use limitation
- CC-BY (Creative Commons - Attribution)
- Access constraints
- License
- Use constraints
- License
- Spatial representation type
- Grid
- Language
- Français
- Character set
- UTF8
- Reference system identifier
- EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6
Spatial representation info
- Number of dimensions
- 0
- Cell geometry
- Area
- Distribution format
-
Name Version
- OnLine resource
-
Protocol Linkage Name NETWORK:LINK
/home/ref-bioinfo/ifremer/sg2m/phobi WWW:LINK-1.0-http--link
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB64019 Publication ENA
- OnLine resource
-
Protocol Linkage Name WWW:LINK-1.0-http--metadata-URL
https://doi.org/10.12770/76beca06-ac02-49ce-810e-94f9c121e868 Digital Object Identifier (DOI)
- Hierarchy level
- Dataset
- Statement
-
Prélèvement de fèces de phoques ont été réalisés sur les sites du Grand Barachois, à Miquelon, et en Baie de Somme différentes espèces de phoques. Pour les virus à ARN, des étapes de purification sont nécessaires (élimination des bactéries) puis de concentration avant extraction des ARN et analyse métagénomique après sélection des ARN viraux.
Metadata
- File identifier
- 76beca06-ac02-49ce-810e-94f9c121e868 XML
- Metadata language
- Français
- Character set
- UTF8
- Hierarchy level
- Dataset
- Date stamp
- 2024-12-09T16:04:56.225855Z
- Metadata standard name
-
ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT
- Metadata standard version
-
1.0
- Metadata author
-
Organisation name Individual name Electronic mail address Role IFREMER
Schaeffer Julien
Point of contact
